CSVファイル内のデータを柔軟にソートするWindowsコマンドがなかなか見つからず、結局LinuxなどでGNU sortを使っています。nanikano.csvというファイル内の第二カラムにある数値で行ごとにデータを降順でソートしようとした場合は以下のようになります。
% sort -nr -t , -k 2,2 nanikano.csv
最近のExcel2010ならば行数制限がメモリいっぱいまででかつての65536行リミットが無くなっているので力ずくでも処理できなくはありません。古いスクリプトを見ると+3などと指定していますが最近のコマンドでは無効らしく検索して調べると、GNU sort(どさにっき)というページがヒットしました。POSIX対応のためごく最近変わったらしい。