検索したところそのままのサクラエディタで「指定した単語を"含まない"行を検索」する(http://d.hatena.ne.jp/wutse/20061024/1161687648)というページがありました。
^((?!target).)*$で正規表現をONにしてgrep機能を使うといけました。助かります。
以前この応用にあたる一致しなかった行全削除(grepの別バージョン)も何かの検証用で作ったのですが忘れたので思い出したら追記しますしました↓。
後日追記）あまり良い方法では無いかもしれませんが、^(?:(?!XXXYYYZZZ[13])) *.*でXXXYYYZZZ[13] で始まる行を空行にすることでどの行を消したかを簡単に検証できます。grep -vとの中間でしょうか。\r\nを付ければ同じ動作になるはずです。